故事以TV版为基础，战斗所剩下的骑士只有六人：城户真司(龙骑)、秋山莲(夜骑)、北冈秀一(钢兵),浅仓威(王蛇),雾岛美穗(FEMME)和神秘的龙牙RYUGA。雾岛美穗成为 骑士的目的是要杀死浅仓为姊姊报仇，并令姊姊复活。而北冈正是帮浅仓脱去杀人罪的律师，他因内疚而多次帮助美穗，可惜美穗并不接受，令他意兴阑珊的退出 骑士之间的战斗。为了报仇的美穗不理真司的阻止，仍多次与浅仓战斗，却反而令自己陷入危机，当浅仓向美穗下毒手时，龙牙突然出现解救美穗，并以强大的力量将王蛇压倒 ，令美穗成功杀死浅仓。由於美穗以为是真司救了她，便相约他出来吃东西希望报答他，而真司和美穗的感情亦得以发展，可惜这个美好时刻却被邪恶的 龙牙破坏。镜世界中的真司(RYUGA)假冒真正的真司袭击美穗，美穗於是与龙牙战斗但不敌，虽然美穗被真司所救，但最後因伤重而死…。　　另一方面取回小时候的记忆的优衣，知道神崎士郎发动战斗的目的是为了自己(详情请看TV版剧情简介的部份)，於是她决定以自杀来阻止神崎士郎的疯狂行为 。另外真司亦知道自己是小时候间接害死优衣的人，令他感到非常内疚。此时镜世界中的真司出现，并欺骗真司说和他合体可拯救优衣，合体後的龇牙以最强Rider的身份向 放夜骑作出挑战。　　得悉优衣已死的神崎士郎受不了打击，在痛哭嚎叫下消失了，镜世界中的成千上万蜻蜓怪因而失控，飞到现实世界袭击人类。战斗中的夜骑与龙牙终於发现优衣的屍体 ，在这个冲击下真司竟从龙牙的身体中分裂出来，并和龙牙作宿命决战。　　最後真司和莲变身成SURVIVE形态，骑著契约兽飞向成千上万的蜻蜓怪，与它们作最後决战，走向未知的未来…。

　　正梅（王茜华 饰）带着女儿欣妍（李小萌 饰）本来过着平静的生活，一天，她突然被医生告知，欣妍患上了白血病，在检查的过程中，正梅更是震惊的得知，欣妍竟然不是自己的亲生女儿。为了给欣妍治病，正梅和前夫郑明远（王志刚 饰）一起踏上了为女寻母的道路，最终，一个名叫夏蓉（徐露 饰）的女人浮出了水面。　　然而，此时的夏蓉已经组织了自己的家庭，为了保护自己的家庭，夏蓉并不准备认欣妍这个女儿。尽管医学上匹配，但是夏蓉不愿意把自己的骨髓捐献出去，只是表示可以承担欣妍的全部医疗费用。

　　羅喉帝身，成就不朽王朝。　　闇夜曙光，編寫千葉傳奇。　　雲海龍吟，天啟驚世金言。　　鬼林沼澤，首開死國年紀。　　【死神傳說】當在北越天海第三根神柱斷裂時，雖神州表面無災害，實際上卻造成死國空間出現裂縫，造成兩隻最強的魖族：天狼星、閻王鎖同時趁機衝出，各自帶著一把死神的鐮刀進入人界。天狼星到孤星崖種下不折之花，後因吸取白蓮之氣而成長。閻王鎖為逼出死神，放出武林三寶傳言：羅喉戒璽、希望號角、不折之花，三者兼得，武林稱主。　　【學海無涯】儒門最高學術組織，統領－太學主，教統－雅僧佛公子與六部執令皆是武林翹楚。後因學海教統改選，由太史侯、東方羿、伏龍先生曲懷觴三人角逐，最終竟由東方羿陰謀得逞，成為學海新任教統。東方羿心機深沉，私底下與滅境邪靈之首未來之宰合作，剷除所有反對勢力，但真正讓東方羿忌憚者，卻是學海最高的統領，消失武林數甲子的太學主。　　【沙溶神法】起波瀾。三面長城玉陽君算計聖獅王朝取得息壤等物，假意欺騙火中雪與釋女華之感情，策劃日盲族慘案，並設計正亦邪、邪亦正導致兄弟反目，終練就沙溶神法，更積極介入羅喉戒璽之爭，察覺織語長心具備的帝王命格，在精密佈局下，意欲讓織語長心戴上羅喉戒璽，成為最新的武林真主，實現統御武林之野心！　　【日盲族】被滅後，殘民戮力密謀復仇，經大祭司測算下找到拯救日盲族的希望，竟是清香白蓮素還真的身影。眾人前往魔界迎回蓮花，孰料取回的卻是因魔氣所產生的影子…黑蓮。黑蓮逐漸孕育成形，成為日盲族認定的救世主「千葉傳奇」，帶領日盲族抗衡當前武林最強大的三股勢力：玉陽君與長心帶領的朱雀殿、東方羿的學海無涯、以及未來之宰龐大的邪靈大軍。　　而在黑暗的沼澤之內，一條頹喪的人影，正默默閱讀一本來自死神的自傳…「死國年紀」。究竟死神的傳說對武林的影響是什麼？朱雀殿、學海無涯與未來之宰三方勢力又將帶來什麼樣的變數？

　　"在某个世界泡中，武装人偶与死士的冲突从未间断过。伴随着二者之间的冲突不断升级，世界泡的稳定性正逐渐降低。为了拯救这个即将崩坏的世界，人类成立了专门用来管理与控制人偶的组织。为了掩盖黑暗的真相，人类特地给组织取了一个非常可爱的名字——「人偶学园」……——啊哈哈，开玩笑的，怎么可能是那样呢？"